6代目箱

1987年の動力ユニット更新と同時に箱が変更され、6代目箱が登場しました。この世代から「プラレール」のロゴが2024年現在まで使われているものに更新されました。
都会から田舎に向かう「2スピード新幹線」のイラストが主体となり、商品名が箱の端に移動し、プラレールロゴの下に表示されるようになりました。商品名の地色が黄色で統一された事から「黄色箱」、また蓋に文字だけのものと写真入りの2種類がある事から前者は「文字箱」や「過渡期箱」と呼ばれるなど、通称が複数ありますが、当館では便宜上「6代目箱」と呼称します。
箱の地色には灰色(無地・斜線入り)・緑色・青色と「のせかえ遊び貨車セット」のみで採用されている水色の4色があります。緑色は1スピードの特急型車両と近郊型車両、青色は通勤型・急行型車両と大まかに使い分けられていますが、「L特急」の初期品と「ディーゼル特急」は青色となっています。灰色は「ライト付車両」「2スピード車両」「ドア開閉車両」「サウンド付」のギミック系車両で採用され、ギミックの内容は切符型の枠に記載されています。「名鉄ブルーライナー」だけはギミック無しにも関わらず、何故か灰色が採用されました。「L特急」は生産途中で2スピード車に変更されたため、青色箱から灰色箱に変更されました。
前述のように登場当初の蓋は商品名の文字のみが記載されていましたが、途中から蓋に車両の写真が入るようになっています。これと同時に対象年齢表記が2歳から3歳に引き上げられ、プラレールロゴに登録商標マーク(®)が付くようになりました。また微妙な差異ですが、イラストの配色が若干変わっています。
カラフルな3両編成の箱に対して、1両単品の箱は黄色と白色のシンプルなデザインとなっています。1993〜94年頃に生産された新動力の1両単品(6代目箱最終生産品)は3両単品と同様のイラストが入ったデザインになりました。

車両はEC箱時代の車両の大半が引き継がれ、その後の新製品との入れ替えで徐々に絶版となっていく形となりました。1987年に登場した新製品は「伊豆急リゾート21」「近郊電車(オレンジライン)」の2つです。
EC箱時代の車両にはディテールアップが施されたものがあり、「電車」「L特急」「東海型急行電車」「おどりこ号」の4車種は屋根がグレーに塗装されています。これは動力スイッチが屋根に移ったことにより、遊ぶ際に屋根のデフォルメも重視されるようになったことから行われた変更だと考えられます。 ちなみに、このうちの「電車(青)」「東海型急行電車」「おどり子号」には新動力になったにも関わらず屋根の塗装が施されていないものが少数ながら存在し、一部のファンの間では屋根未塗装新動力のように呼ばれ、地味な激レア品として知られています。
1988年から続々と新製品が発売されるようになり、車種置き換えが始まりました。例えば「ロマンスカー」は「ニューロマンスカー」に、「名鉄パノラマスーパー」は「名鉄ブルーライナー」に置き換えられています。
新旧の置き換え以外の例もあり、平屋中間車で発売された「近郊電車(オレンジライン)」は、1990年に中間車をダブルデッカーとした「近郊電車ダブルデッカー」に変わっています。
1994年に発売された「東武スペーシア」「名鉄ブルーライナー」は発売から短期間で箱更新を迎えて7代目箱に移行した事から、6代目箱の姿での発売期間はかなり短く大変貴重なものとなっています。